Podczas eksploracji Sokotry można również odkryć wiele jaskiń ze względu na obfitość wapienia.

Większość systemów jaskiniowych składa się z mniejszych nawisów i tuneli, ale niektóre jaskinie zaskoczą Cię swoimi rozmiarami.Jednym z takich systemów jest największa jaskinia Hoq (Al-Hoq), która ma 3 kilometry długości.

Znajduje się ona w przepaści w północno-wschodniej części Sokotry. Wielka granitowa ściana góruje nad brzegami wyspy.

Wejście na górę zajmuje około 2 godzin i samo w sobie jest niezłą przygodą. Po drodze można zaobserwować różnego rodzaju sukulenty i inne rośliny, które przypomną nam o dawno minionych dniach. Nagrodą za 2-godzinną wspinaczkę jest oszałamiający widok na lazurowe morze.

Wewnątrz jaskini nie ma żadnych świateł, ścieżek ani poręczy. W środku jest ciemno i zimno, ponieważ jaskinia jest wciąż nietknięta ludzką ręką. Konieczne jest więc zabranie własnego światła.  Eksploracja Hog to kolejne niesamowite doświadczenie, a jaskinia jest zdecydowanie warta odwiedzenia.

Formacje wapienne w jaskini zapierają dech w piersiach, a ostatnie odkrycia archeologiczne sugerują, że jaskinia odegrała kluczową rolę w historii wyspy. Główny tunel jest bardzo długi i dość wysoki na początku. Wyróżniającą się formacją jest stalagmit, który góruje nad jeziorem na (jak się uważa) końcu jaskini.

Kolejna jaskinia, Dagub, znajduje się na południowym brzegu, za wydmami Hayf i Zahaq. Do tej jaskini można łatwo dojechać samochodem. Przy wejściu znajdziemy najcenniejszy płyn południowej części wyspy - czystą wodę. Ze względu na obecność wody, jaskinia jest siedliskiem wielu różnych zwierząt, zwłaszcza nietoperzy i jerzyków.